El intento del nacimiento de la Academia Boliviana de Medina se remonta al año de 1932, cuando Juan Manuel Balcázar menciona la tentativa realizada por el doctor Ezequiel L. Osorio para organizar la Academia Nacional de Medicina, contando con la voluntad de los miembros del Instituto Médico Sucre mediante gestiones ante la Universidad de Chuquisaca y las pocas sociedades médicas existentes, así  como ante el gobierno presidido por Daniel Salamanca, lastimosamente dicha solicitud no prosperó, posiblemente porque en la época Bolivia se encontraba en una contienda bélica con el país vecino del Paraguay.

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El 6 de agosto de 1939, se emitió el Decreto Supremo No. 690 firmado por el Tcnl. German Busch, presidente de la República, se autoriza la creación de la Academia Boliviana de Medicina, considerando el propósito del gobierno de fomentar la cultura científica del país con la organización de altos centros de estudio e investigación, con la intención de que esta institución fuese inaugurada el 9 de diciembre del mismo año en honor a la Batalla de Ayacucho. En este decreto se autorizó a los Decanos de las Facultades de Ciencias Médicas que, junto a los catedráticos de las mismas, Institutos y Profesionales Médicos del país, procedan a la organización de la Academia, asignándose al señor ministro de Educación bellas artes y asuntos indígenas a dar cumplimiento al decreto en mención. Los firmantes fueron Tcnl. Germán Busch., A. Mollinedo, Pou Mont, W. Méndez, B. Navajas Trigo, Leitón, Mercado Rosales, F. M. Rivera, R. Jordán Cuéllar, M. Flores, C. Salinas A.